MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL8

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012003	A	6	6	221	226	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
2	NC_012003	A	6	6	304	309	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
3	NC_012003	ATA	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143523
4	NC_012003	TG	3	6	354	359	0 %	50 %	50 %	0 %	222143523
5	NC_012003	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143523
6	NC_012003	A	6	6	428	433	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
7	NC_012003	ATTT	2	8	436	443	25 %	75 %	0 %	0 %	222143523
8	NC_012003	TTAACG	2	12	446	457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222143523
9	NC_012003	GAA	2	6	476	481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143523
10	NC_012003	AGA	2	6	484	489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143523
11	NC_012003	A	7	7	496	502	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
12	NC_012003	GAAAA	2	10	529	538	80 %	0 %	20 %	0 %	222143523
13	NC_012003	A	7	7	535	541	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
14	NC_012003	GAT	2	6	550	555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143523
15	NC_012003	GAT	2	6	602	607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143523
16	NC_012003	TTA	2	6	667	672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143523
17	NC_012003	CA	3	6	730	735	50 %	0 %	0 %	50 %	222143523
18	NC_012003	A	6	6	747	752	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
19	NC_012003	AAC	2	6	764	769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143523
20	NC_012003	ATCA	2	8	821	828	50 %	25 %	0 %	25 %	222143523
21	NC_012003	A	6	6	828	833	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
22	NC_012003	AAGA	2	8	904	911	75 %	0 %	25 %	0 %	222143523
23	NC_012003	A	6	6	916	921	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
24	NC_012003	TAT	2	6	977	982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143523
25	NC_012003	ACTG	2	8	1024	1031	25 %	25 %	25 %	25 %	222143523
26	NC_012003	AAG	2	6	1032	1037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143523
27	NC_012003	A	6	6	1038	1043	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
28	NC_012003	ATCA	2	8	1049	1056	50 %	25 %	0 %	25 %	222143523
29	NC_012003	GAA	3	9	1076	1084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143523
30	NC_012003	A	7	7	1089	1095	100 %	0 %	0 %	0 %	222143523
31	NC_012003	A	7	7	2074	2080	100 %	0 %	0 %	0 %	222143524
32	NC_012003	ATTA	2	8	2106	2113	50 %	50 %	0 %	0 %	222143524
33	NC_012003	CTT	2	6	2201	2206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143524
34	NC_012003	AGA	2	6	2240	2245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143524
35	NC_012003	ATC	2	6	2258	2263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143524
36	NC_012003	TG	3	6	2269	2274	0 %	50 %	50 %	0 %	222143524
37	NC_012003	GTA	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143524
38	NC_012003	AAAT	2	8	2307	2314	75 %	25 %	0 %	0 %	222143524
39	NC_012003	A	7	7	2346	2352	100 %	0 %	0 %	0 %	222143524
40	NC_012003	TGG	2	6	2415	2420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222143524
41	NC_012003	GAC	2	6	2464	2469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222143524
42	NC_012003	ATG	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143525
43	NC_012003	A	8	8	2841	2848	100 %	0 %	0 %	0 %	222143525
44	NC_012003	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143525

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.